中医认为百合花具有润肺止咳、清心安神的作用，尤其是鲜百合花更甘甜味美。百合花特别适合养肺、养胃的人食用，比如慢性咳嗽、肺结核、口舌生疮、口干、口臭的患者，一些心悸患者也可以适量食用。但由于百合花偏凉性，胃寒的患者少用。冬季到来，需要润肺、养胃的人越来越多。百合花可清心润肺、安神定志，很适合被失眠困扰的人食用。临床研究显示可取得较为显著的疗效。另外在服药的同时配合一些行为疗法，包括食疗。平时清淡为主，不要吃辛辣食物。患者应该培养起较好的生活习惯，如晚饭后多散步，平常多运动等等，这些对于症状的恢复均有很好的帮助。
不过风寒咳嗽、虚寒出血、脾胃不佳者忌食百合花。曾用百合花对鼠类、犬类的实验中发现长时间/大剂量食用会导致肺、肾的损坏及对白细胞、血小板的影响，即使是食用百合花也有一定毒性，所以建议使用前向医师咨询。直接接触生的球茎可能会引起皮肤瘙痒，吞噬生的球茎可能会引起呕吐、拉肚子等症状。